不允许穴盘苗完全干燥；反之，基质中水分过于饱和也不行，会造成根系缺氧（0-2%）
穴盘苗生产水分管理一般以子叶展开为分界线。
在子叶展开之前的水分管理比较简便，即要穴孔基质的下半部一直保持湿润。仅仅控制穴孔上半部分基质的干湿交替即可。
我国近几年大量用于蔬菜和花卉商品育苗。用穴盘育苗是一项新技术。穴盘是分格的，生产育苗盘，播种时1穴1粒，分苗时1穴1株。通过大量生产实践证明，它与常规育苗相比有以下优点：
改善劳动环境，便于手工操作。可坐在温室的休息室内，32孔育苗盘，把穴盘放在操作台上，往穴盘里播种或分苗。作业后放到温室里。
育苗盘
穴盘育苗种苗起苗移栽简捷、方便，不损伤根系，定植成活率高，扦插育苗盘，缓苗 期短。
可以抬起穴盘看盘底部的基质是否变干，以此决定是否补充水分。
用穴盘育苗是一项新技术。穴盘是分格的，播种时1穴1粒，分苗时1穴1株。
移栽时不损伤根系，缓苗迅速，成活率高。
穴盘育苗在由填料、播种、催芽等过程中均可利用机械完成， 操作简单、快捷，适于规模化生产。
比如遇到以下状况，水只到穴孔一半比较合适：
天气由晴转阴、转冷，或者温室内湿度特别高。水分蒸发较慢，蒸腾作用较低，穴盘不易变干。 2、穴孔下半部仍旧有一定湿度。
节省育苗场地和降低成本。用穴盘播种，让小苗在穴盘里生长，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗、或定植；在育苗盘里播种，把籽苗移入穴盘，长大后再移入育苗钵、或开沟分苗、或定植；这样开始占地少，尤其适于在早春温度低时培育小苗，外界温度升高后再移入其他保护地培育成苗，可减少加温费用。如果不用较大的苗定植，育苗盘，可直接用穴盘苗栽培。
培育生长量较小的苗用穴盘，培育生长量较大的苗用育苗钵或在苗床开沟培育。穴盘苗小，抗性弱，大地条件恶劣的不用穴盘苗。
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